Głównym celem Akatsuki jest złapanie wszystkich Jiinchuuriki i zapieczętowanie ogoniastych bestii, dzięki którym zdobędą władze nad światem i zaprowadzą swoją wizję 'pokoju'. Każdy z jej członków ma jakieś poboczne cele, które stara się zrealizować.

W tym dziale Lider Akatsuki może wyznaczać poszczególne cele dla poszczególnych osób.